方案中明确指出现行化肥价格调控机制的主要问题:实行限价等措施与化肥上下游绝大部分产品价格已市场化不相适应；运用行政手段控制价格与化肥生产、流通渠道和所有制的多元化不相适应；化肥生产企业因使用不同原燃料所享受的政策优惠不一；部门、行业、地方利益使优惠政策难以完全落实到位；缺乏有效解决化肥生产与季节性消费矛盾的市场手段。 为解决上述问题，方案提出以下思路和政策建议:放开化肥价格，逐步取消对化肥生产和流通环节的优惠政策，理顺价格关系；建立对农民的化肥涨价补贴制度；改革完善现行淡季化肥商业储备制度，建立中央和地方两级化肥储备制度以及运用储备平抑价格的调控机制；发挥税收杠杆作用，及时调节化肥供求；规范流通秩序，建立完善化肥价格监测预警机制，提高政府调控能力。方案实施将对化肥行业产生深远影响，对尿素行业影响最大，磷肥次之，钾肥最小。
化肥涨价补贴是由财政部主导的，而非发改委执行。据相关人士介绍，农民补贴受实施方式难于操作、难于明确补贴对象、国内地区性差异大，难以应对尿素价格大幅波动等因素限制，短期内实施难度较大。从目前情况看，2005年粮食价格不仅难以继续大幅上涨，而且还呈稳中略降的态势。在重视三农问题的背景下，国家仍会通过多种手段控制化肥上涨，大幅提高出口关税限制出口，增加国内市场供给，就是很好的手段。因此我们判断放开化肥价格后，尿素价格上涨存在难度。
国内煤、气、油、电以及运输费用难以下降，尿素生产成本难以降低。取消化肥行业的优惠政策无疑将抬高尿素企业生产成本。
总之，完全实施《改革和完善化肥价格调控机制方案》的政策，尿素行业将面临成本上升，利润水平下降的局面。尤其危及小规模企业的生存和发展，对尿素行业上市公司冲击相对较小。目前尿素行业运行情况良好，多家上市公司预增半年报业绩。《改革和完善化肥价格调控机制方案》仅处于征求意见阶段，具体实施尚待观察。前期下跌已经部分释放该方案的利空因素。
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