但是，天颐带来了债务和亏损，以及不断的职工和管理层之间的矛盾。这些在后来深刻影响了天发集团的产权争夺。数据显示，天发接手活力28的债务为1.1亿元，累计亏损达5个亿。1000多名职工因为活力28被天发集团收购后仍然没有得到明显的改善，对活力28的改制、管理以及职工“三金”的安置不服，不断上访告状，职工和企业之间的矛盾日益激化。2003年起，原活力28的职工开始聚众闹事。于是，荆州市政府就用一纸批文收回了天颐科技。

　　无论如何，通过收购亏损国企，天发集团资产迅速膨胀，龚家龙沉醉于眼前的虚涨体系。天发集团有限公司成为涉足成品油、石油液化气经营等领域的大型企业集团，分为石化、农业、造纸三大板块，拥有“天颐科技”、“天发石油”(在全国民营石油商中惟一拥有牌照)两个上市公司，还拥有天发物流有限公司等十多家全资子公司。高峰时期，号称拥有总资产60多亿元，养活了半个荆州市。

　　但是，天发集团在工商银行的贷款均为流动资金贷款，包括兼并武汉纸厂、活力28的中长期项目贷款也转成了短期流动资金贷款，使之每年还本付息压力巨大；天发集团的农业项目和新建项目使其每年需要20个亿的流动资金；同时，石油产业因为管制造成的亏损在蔓延。

　　2001年3月，天发股份实施了2000年度配股计划，实际募集资金3.97亿元。但是配股项目的投入并没有给天发股份带来预期的利润增长，公司在2001年反而出现业绩大幅下滑，当年公司仅实现净利润223.43万元，比2000年的5236.1万元下降95.73%，2002年上半年突变为2549.1万元的巨额亏损。

　　为了维持资本通道，龚家龙开始频繁造假。中国证监会于2002年8月28日进入天发进行稽查，天发石油 (000670)由于2000年度、2001年度财务报告存在虚假陈述，配股资金实际使用情况与信息披露不符，隐瞒重大事项等违规行为遭到了中国证监会的行政处罚。

　　2003年，公司因将未到账的财政补贴1600万元计入利润表，同时未及时披露会计差错而受到证监会的公开谴责。对此，龚家龙的解释是，当时因为天发石油的成品油经营牌照被收回，两大石油集团不给天发足够的油，天发石油只能偷偷摸摸地进黑油卖，维持销售，因此无法取得销售凭证，只能被迫造假。

　　2004年中国证监会的“行政处罚决定书”称，天发石油配股募集的3.4亿元资金到位不久即大部分用于归还贷款本息和被大股东天发集团占用；决定对天发石油罚款60万元，对公司原董事长刘道兴予以警告并罚款10万元，对时任董事龚家龙予以警告并罚款20万元，并对刘道兴、龚家龙实施5年市场禁入。

　　但是，造假也不能拯救业绩低下，2004年，天发石油、天颐科技相继进入ST行列，天颐因2001年至2004年连续四年业绩造假被证监会立案调查。2005年还查出天发集团利用向上市公司出让土地使用权和拆借等方式，侵占S*ST天颐的巨额资金。2005年5月深圳证券交易所对天发石油股份有限公司及相关人员予以公开谴责。

　　长期亏损，两个上市公司被调查，不能通过股市募资，加上股市长期处于熊市，资本通道堵塞，天发只能求助于银行贷款。

　　2003年，天发集团资金链告急，以贷还贷来维持资金周转的模式已经行不通。2003年11月底，一笔5000万元的贷款到期，天发不能偿还，想要续贷付息，工行不理。次年，天发的资金链危机开始集中爆发，开始拖欠当年1亿多元的贷款利息。因为天发的规模太大，而且又牵涉到和大量农民的菜籽收购欠款问题。自此，天发的资金链问题演变成为一个惊天大案。

　　更要命的是来自商业银行贷款的冻结。2004年10月，工行荆州分行将天发起诉至湖北省高院，要求其偿还其在中国工商银行荆州市红门路支行借款本金1.49亿元及相应利息。湖北省高院在2005年3月判令天发石油还款。此时，天发已经不可能从荆州市银行借到钱。湖北省2004年组织了5个会计事务所分5个方面对其清产核资，结果是天发集团资产43亿元，已拖欠银行贷款高达27亿元，其中流动负债20.79亿元，长期负债6.96亿元。普华永道审计的结果则是天发集团此时资不抵债达10亿元。